Un savant américain expert en symbole est appelé auprès du corps assassiné du directeur du Louvres. Une multitude de signes et d'indices l'entraîne dans une enquête périlleuse et il est aidé sans sa quête par une charmante jeune femme, cryptologue de profession. Ils se rendent vite compte qu'à travers l'oeuvre de Leonard de Vinci est dissimulé un secret millénaire qui va menacer l'équilibre du monde. Seront-ils assez forts pour affronter ces révélations et pourront-ils résister au terrible Silas, un tueur mystique employé par une mystérieuse organisation religieuse?